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shoot.bio

生命树序列查询工具

5.0/10 中国可用
TTG4G 编辑组 ·更新于 2026-06-08 ·数据来源: ai_crawl 评测方法 ↗
数据来源
ai_crawl · 最近更新 2026-06-08
行业深度解析AI 深度分析
一句话SHOOT.bio 是一个用于基因序列相似性搜索、同源基因推断与系统发育树可视化的在线系统发育搜索引擎。
适合谁生命科学、基因组学、生物信息学相关研究者与需要进行基因家族、直系同源基因和系统发育分析的用户
核心功能输入蛋白序列进行系统发育搜索在多个数据库中查找相似序列生成并可视化包含查询序列的系统发育树推断不同物种中的直系同源基因支持 Metazoa、Plants、Fungi、Bacteria & Archaea、LUCA/UniProt 等数据库提供高级选项,如 DIAMOND 数据库、灵敏度、MAFFT 选项和超树方法支持本地命令行部署
授课语言英文界面/英文说明
师资/机构背景页面引用 Emms, D.M. 与 Kelly, S. 发表的 SHOOT: phylogenetic gene search and ortholog inference,Genome Biology 2022;系统涉及 OrthoFinder、MAFFT、FastTree、RAxML EPA、phylotree.js 等工具。
适合人群生命科学、基因组学、生物信息学研究人员,以及需要进行基因家族、直系同源基因和系统发育分析的用户。
中国访问未知
适用场景基因相似序列搜索、基因家族识别、直系同源基因推断、系统发育树生成、基因演化历史分析、在自有基因组资源网站中集成基因搜索工具
同类BLAST、OrthoFinder、本地 DIAMOND/MAFFT/FastTree/RAxML 流程、UniProt 与 Ensembl 相关检索工具
性价比7
易用6
服务5
综合7
优点
  • 定位清晰,专注于系统发育层面的基因搜索与同源推断
  • 数据库覆盖动物、植物、真菌、细菌与古菌等多个生命域
  • 方法链条较透明,说明了 OrthoFinder、MAFFT、FastTree、RAxML EPA 等工具使用方式
  • 结果不仅类似 BLAST 查找相似序列,还能提供基因树和演化关系视角
  • 采用 CC BY 4.0 许可,并提供论文引用方式
不足
  • 不是教育课程产品,缺少课程体系、教学服务、证书和学习路径信息
  • 页面未提供价格、支付方式或账户服务说明
  • 对非生物信息学背景用户门槛较高
  • 数据库虽为 curated,但特定物种或场景可能仍需用户自行判断覆盖范围
  • 树根位置在部分情况下可能需要人工重新判断

深度测评

TG4G · 2026-06-08 更新 · 仅供参考

是什么

SHOOT.bio 从抓取内容看并不是教育/课程产品,而是一个系统发育搜索引擎。用户输入蛋白序列后,系统会在预构建的基因家族数据库中搜索,并把查询序列嫁接到系统发育树上,用于查找相似序列、识别基因家族、推断直系同源基因并观察基因演化历史。

核心能力与技术基础

它支持多个数据库方向,包括所有生命域、Metazoa、Plants、Fungi、Bacteria & Archaea 等。技术流程说明较充分:同源基因组由 OrthoFinder v3 推断,序列比对使用 MAFFT,树构建使用 FastTree,用户查询序列通过 MAFFT 加入比对并用 RAxML EPA 加入预计算树;可视化依赖 phylotree.js。相比单纯 BLAST,它更强调“相似性搜索 + 系统发育关系”的综合判断。

定价、证书与教学属性

页面没有呈现课程价格、直播/录播/1v1 授课形式、证书或学习服务信息,因此不能按常规课程平台评估。许可方面,SHOOT 及其产生数据采用 CC BY 4.0;页面还给出 Genome Biology 2022 论文引用方式。它更像科研工具和开放资源,而非培训课程。

优缺点

优点是数据库经过整理,覆盖动物、植物、真菌、细菌与古菌,能帮助用户从基因家族演化角度理解查询序列;方法透明,并支持下载命令行版本、本地运行及自建数据库。局限在于使用门槛较高,需要用户理解蛋白序列、同源基因、系统发育树和树根判断等概念;页面也提示在某些情况下树可能需要人工重新定根。

适合谁与中国访问

它适合生物信息学、进化生物学、比较基因组学研究者,以及维护基因组资源网站的团队。中国访问情况抓取文本未提供,支付方式也无信息;若在线访问不稳定,可考虑本地命令行版本,或使用 BLAST、OrthoFinder、DIAMOND、MAFFT、FastTree、RAxML 等工具自行搭建替代流程。

本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 shoot.bio 官网实际信息为准。

中文卖点

在线生物序列查询工具,科研学习可用。

官网快照

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常见问题

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