在线ROC曲线分析工具
各维度得分依据公开资料与字段推算,加权后即综合评分,仅供参考。
ROC Plotter(域名为rocplot.com)是一款专门面向肿瘤研究领域的在线ROC分析工具,由开发了知名生存分析工具Kaplan Meier Plotter的团队推出,核心用途是基于转录组水平数据验证癌症治疗预测生物标志物的诊断性能,也是全球首个公开可用的转录组水平预测生物标志物在线验证工具。
ROC Plotter的核心功能是通过ROC曲线分析评估生物标志物对肿瘤治疗应答的分类能力,可输出曲线、AUC值(曲线下面积,衡量分类性能)、p值,还能自动识别区分应答者和非应答者的最优基因表达截断值。
工具内置数据覆盖多种肿瘤类型:公开数据集包含乳腺癌、卵巢癌、胶质母细胞瘤、结直肠癌临床样本、泛癌miRNA数据、体外细胞系数据,总共可识别70632种基因符号,覆盖HGNC官方批准符号、历史符号和别名。此外工具还提供2023到2026年多批次免疫治疗数据集(含血液样本版本)以及前列腺癌数据集,仅对商业授权用户开放,需要密码访问。除了内置数据,ROC Plotter还支持用户上传自定义数据生成ROC分析结果。
同一站点还可跳转该开发团队的其他肿瘤研究工具:用于生存生物标志物验证的Kaplan Meier plotter、用于肿瘤/正常/转移组织基因表达比较的TNMplotter、关联突变与表达变化的muTarget等。
ROC Plotter的所有公开数据集功能和自定义数据上传功能均可免费使用,仅私有版本的最新免疫治疗、前列腺癌数据集需要联系A5 Genetics Ltd获取商业授权,网站未公开授权具体价格。
优势方面,该工具领域针对性极强,解决了肿瘤生物标志物验证需要整理大规模临床转录组数据的痛点,普通研究者不需要自己搭建分析环境,上传基因即可获得分析结果,使用门槛极低;同时配套同系列工具,可以一站式完成从生存分析到标志物验证的全流程研究。
劣势方面,最新的数据集都锁定在商业授权板块,普通科研用户无法访问;仅依靠已发表论文说明分析方法,没有公开的详细使用教程,对新手不够友好。
该工具适合肿瘤学研究者、生物信息学科研人员、癌症生物标志物开发团队使用,尤其是需要快速验证候选预测标志物的小规模研究团队。抓取内容中未明确记录中国地区访问情况,访问状态未知。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 rocplot.com 官网实际信息为准。
科研生信分析工具,免费可用价值高。
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