蛋白结构预测服务
各维度得分依据公开资料与字段推算,加权后即综合评分,仅供参考。
Robetta 是华盛顿大学 Baker Lab 开发的蛋白质结构预测服务器,核心依托 Rosetta macromolecular modeling suite。其主要目标是根据氨基酸序列预测蛋白三维结构,并通过 CAMEO 持续评估。网站披露其在一年、900 多个 CAMEO 预发布 PDB 目标上的平均 lDDT 约为 69,属于有公开评估依据的科研型工具。
Robetta 提供五类结构预测选项:RoseTTAFold、TrRosetta、RosettaCM、RosettaAB,以及自动结构域预测后分域建模再组装的流水线。比较建模会使用 PDB100 模板库、MDB 共进化模型库,并结合 RaptorX、HHpred、Sparks-X、Map align 等模板检测和比对方法。用户也可上传自定义 PDB 模板、FASTA 格式比对,修改比对并添加距离约束。
Robetta 可进行部分多链复合物建模:同源寡聚体可在比较建模中通过模板生物学单元识别;异源寡聚体可通过 RoseTTAFold 或 CM 建模,但 RoseTTAFold 需要用户提供配对 MSA,CM 支持自定义模板、比对和链间约束。需要注意的是,异源寡聚体比较建模尚未充分测试;当前不能直接建模蛋白-配体复合物,配体会在提交时被省略。
正文未披露收费模式。用户必须注册登录后提交任务,通过网页交互界面粘贴或上传序列、模板和约束;结果可在 My queue 查看,也会通过邮件发送,并可下载包含模型、模板、比对、片段、约束和命令的归档。任务通常需要一天到数天,大型多结构域任务可能超过一周,且为避免队列过长,用户一次只能建模一个结构域。
优点是学术背景强、方法丰富、可自定义程度高,并提供误差估计和模型置信度。缺点是偏科研工作流,未见 API/SDK、自托管和定价说明,排队与运行时间不适合强实时需求。它适合结构生物学、生物信息学和蛋白工程研究人员;若在中国访问,正文未提供网络和支付信息,建议同时准备 AlphaFold、ColabFold、SWISS-MODEL 等替代方案。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 robetta.org 官网实际信息为准。
科研价值高,提供蛋白结构预测提交与队列。
评分明细(分布与用户短评)接入中。当前展示 TG4G 综合评分,数据源自公开测评与用户反馈。