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微生物同源基因库

6.0/10 中国可用
TTG4G 编辑组 ·更新于 2026-06-08 ·数据来源: ai_crawl 评测方法 ↗
数据来源
ai_crawl · 最近更新 2026-06-08
行业深度解析AI 深度分析
一句话面向细菌与古菌完全测序基因组的同源基因预测与比较基因组学数据库。
定价免费/未说明
适合谁比较基因组学、微生物基因组学、生物信息学研究人员及相关课程/科研训练用户
核心功能提供基于 Ortholuge 方法的正交同源基因预测支持多个基因组间正交同源基因存在/缺失比较支持两个基因组之间获取正交同源基因并可返回特有基因支持按单个基因 ID 或名称检索同源基因列表提供 reciprocal best hit、in-paralog 和 proposed ortholog groups 信息可显示同源基因的局部基因上下文
课程领域生物信息学、比较基因组学、微生物基因组学
授课语言英文
师资/机构背景数据库和方法由相关论文描述,包括 OrtholugeDB 论文发表于 Nucleic Acids Research,Ortholuge 方法发表于 BMC Bioinformatics;正文未提供具体机构信息。
适合人群研究细菌和古菌基因组的科研人员、生物信息学学习者、需要正交同源基因预测与比较分析的用户
中国访问未知
适用场景细菌/古菌正交同源基因查询、比较基因组学分析、筛选特有基因、查看基因邻域、辅助生物信息学课程案例或科研训练
同类InParanoid、OrthoDB、eggNOG、KEGG Orthology、NCBI BLAST/比较基因组学相关数据库
性价比7
易用6
服务4
综合6
优点
  • 方法有同行评议论文支撑,适合科研引用
  • 针对细菌和古菌全基因组比较分析较聚焦
  • 提供 Ortholuge 分类,有助于区分高可信与异常分化的预测结果
  • 检索场景覆盖单基因、双基因组和多基因组比较
不足
  • 不是通用教育课程平台,缺少系统教学内容、作业与学习路径
  • 授课形式、证书、价格、师资等课程信息未提供
  • 仅覆盖完全测序的细菌和古菌基因组,适用范围较窄
  • 部分结果依赖合适 outgroup,缺失时只能提供 RBBH 预测

深度测评

TG4G · 2026-06-08 更新 · 仅供参考

是什么

OrtholugeDB 是一个面向完全测序细菌与古菌基因组的正交同源基因数据库,核心不是传统意义上的在线课程,而是可用于生物信息学教学、科研训练和比较基因组学分析的专业工具。它收录基于 Ortholuge 方法的 orthology predictions,同时也包含 reciprocal best hit、in-paralog 预测和 proposed ortholog groups。

核心维度测评

从课程领域看,它对应生物信息学、比较基因组学和微生物基因组学。平台提供多种分析入口:可在多个基因组中比较同源基因存在/缺失,可在两个基因组间获取正交同源基因并选择返回某一方特有基因,也可按单个基因 ID 或名称检索同源基因列表,并支持查看局部基因上下文。其方法基础较强:OrtholugeDB、Ortholuge 方法及局部 FDR 计算均有论文说明,适合需要严谨方法来源的科研用户。

定价与课程属性

正文未显示收费、订阅、证书、直播、录播或 1v1 辅导信息,因此不能视为完整课程产品。它更适合作为高校课程、实验课或科研项目中的数据库案例使用,而非独立学习平台。授课语言方面,网页内容为英文;认证/证书、师资课程团队和支付方式均未披露。

优缺点

优点在于定位聚焦、方法透明,并通过 SSD、Borderline-SSD、Divergent Non-SSD、Similar Non-SSD、RBB 等分类帮助用户判断预测可信度。它也解释了 inparalog、outgroup、CVtree 距离等关键概念,便于进阶学习。局限是覆盖对象较窄,仅限细菌与古菌完全测序基因组;当缺少合适 outgroup 或 outgroup 基因时,部分分析无法获得 Ortholuge 分类,只能依赖 RBBH 预测。此外,它缺少教学路径、练习反馈和学习支持。

适合谁与中国访问

适合微生物基因组学研究者、生物信息学学生、需要筛选特有基因或验证正交同源关系的用户。中国访问情况正文未提及,网络连通性、支付和替代访问方案未知。若访问不稳定,可考虑 OrthoDB、eggNOG、InParanoid、KEGG Orthology 或 NCBI BLAST 等替代工具。综合看,它的科研价值高于课程价值,适合作为专业分析资源补充使用。

本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 ortholugedb.ca 官网实际信息为准。

中文卖点

科研数据库,适合生信研究者

官网快照

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价格走势

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常见问题

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