一句话面向微生物组研究的免费在线数据处理与可视化 Shiny 应用集合。
定价免费/捐赠支持 正文称目前希望网站 entirely free;如希望支持更新和托管成本,可通过 PayPal 捐赠。
适合谁微生物组研究人员、PI、本科研究助理、生物信息学初学者及需要从 Mothur 数据快速生成图表的科研用户
核心功能基于 R Shiny 的在线应用使用 ggplot2 生成可定制图表支持 Mothur 微生物组数据处理后的可视化相对丰度柱状图和箱线图Alpha Diversity 图BF RatiosSac Sheets 时间点数据可视化Heatmaps 热图应用
功能与用途Guthub 是一个面向科学研究,尤其是微生物组数据处理和可视化的网站。它通过多个 R Shiny 应用,将 Mothur 数据处理流程后的结果转化为 ggplot2 风格图表,减少用户反复修改 R 脚本的需要。正文列出的应用包括 Abundance Barplot、Abundance Boxplot、Sac Sheets、Alpha Diversity、BF Ratios 和 Heatmaps。
支持语言/框架正文明确提到应用 entirely created in Shiny and R,并使用 ggplot2 生成图形;与 Mothur 微生物组数据处理程序相关。
自托管选项正文称 Guthub 是 privately hosted website,但未说明是否支持用户自托管或部署源代码。
定价目前希望网站 entirely free;作者接受 PayPal 捐赠以支持应用开发、网站运行和文件托管成本。
集成与生态与 Mothur、R、Shiny、ggplot2 相关;作者提到学习资源来自 Datacamp、Stackoverflow 等,但未说明正式集成能力。
文档质量网站提供 Explainers,面向初学者介绍生物信息学基础,也为高级用户提供不同图形分析的逐步说明。正文未展示文档完整性、版本化或 API 文档。
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适用场景将 Mothur 处理后的微生物组数据快速生成相对丰度图、Alpha Diversity 图、BF Ratios、Sac 数据图和热图;帮助没有 R 编程经验的学生或实验室成员参与数据可视化。
同类R/RStudio、Shiny Server、ggplot2、自建 R Shiny 应用、QIIME 2 可视化工具、Mothur 配套脚本