基因组流行病学研究服务与学术机构
genomicepidemiology.org是丹麦技术大学基因组流行病学中心(CGE)运营的非营利性学术在线工具平台,核心目标是降低基因组流行病学、病原微生物研究的技术门槛,让全球不同资源水平的机构和研究者都能获取专业的生物信息学分析能力,解决测序技术普及后,分析能力分布不均的问题。
该平台提供覆盖基因组流行病学研究全流程的免费在线分析工具,包括表型分析、菌株分型、移动元件鉴定三大类:可完成抗生素耐药基因鉴定、细菌致病力预测、毒力基因识别、多位点序列分型、质粒鉴定、血清型预测、细菌物种鉴定等核心研究任务,支持Illumina、Nanopore等不同测序平台的原始reads和组装后基因组输入,满足基础病原微生物研究、传染病暴发溯源等多类需求。需要注意当前域名主页面已标记为 legacy 遗留页面,工具整体迁移至新平台,需跳转访问。
该平台所有工具完全免费开放,无任何付费功能,对研究者非常友好。访问无需特殊手段,国内可以直连跳转新平台使用,但目前无中文界面,适合有一定英文基础的科研人员。
该平台非常适合病原微生物、公共卫生领域的科研人员、防疫工作者使用,尤其是入门研究者或资源有限的团队,无需自行搭建复杂分析流程即可获得专业结果,是学术研究中非常实用的免费公共资源。
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专注测序技术在传染病等生物领域的应用研究
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