一句话EpiLPS 是一个用于传染病统计建模的 R 包,基于 Laplace 近似与 Bayesian P-splines,支持时变再生数估计、nowcasting 与潜伏期分布估计。
定价免费/开源软件 正文未提及商业定价;稳定版本可在 CRAN 获取,开发版本在 GitHub 仓库提供。
适合谁流行病学研究者、生物统计学家、公共卫生建模团队、使用 R 进行传染病数据分析的科研人员
核心功能估计传染病时变再生数 Rt基于 Bayesian P-splines 平滑疫情曲线使用 Laplace approximations 实现快速推断支持 LPSMAP 与 LPSMALA 两种估计策略支持 nowcasting 与 nowcasting reproduction number支持半参数方式估计潜伏期分布提供 R 函数 estimR、estimRmcmc、epicurve、Idist、episim 等核心计算例程使用 C++ 并通过 Rcpp 集成
功能与用途用于传染病统计建模的小型推断生态,核心包括时变再生数估计、再生数 nowcasting、Bayesian nowcasting、潜伏期分布估计、发病率曲线平滑与模拟。
支持语言/框架R 包;核心计算例程使用 C++,通过 Rcpp 集成到 R。正文未提及其他语言或框架支持。
开源还是闭源正文提供 GitHub 仓库与 CRAN 包,指向开源分发;具体许可证未在正文中出现。
自托管选项作为 R 包可在本地 R 环境安装运行;正文未提及服务端部署或托管平台。
定价未提及收费;CRAN 与 GitHub 可获取,推定为免费学术软件,但正文未给出许可证和商业条款。
API/SDK提供 R 函数接口,包括 estimR()、estimRmcmc()、epicurve()、Idist()、episim() 以及 S3 summary/plot 方法;未提及 Web API 或 SDK。
集成与生态发布于 CRAN,开发版本位于 GitHub;依赖 Rcpp 集成 C++ 计算;与 R 语言统计建模和可视化工作流结合。
文档质量网站提供功能概览、文档、vignettes、安装方式、代码示例、方法解释和参考论文;对专业用户较充分,但对非统计背景用户门槛较高。
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适用场景估计疫情期间时变再生数、nowcasting 传染病指标、估计潜伏期分布、模拟发病率时间序列、公共卫生干预评估中的流行病学建模。
同类正文提到可同时计算 Cori et al. (2013) 和 Wallinga and Teunis (2004) 方法;未列出具体替代软件名称。