在线分子对接建模
各维度得分依据公开资料与字段推算,加权后即综合评分,仅供参考。
DockingServer 是 Virtua Drug Ltd 维护的在线分子对接与分子建模服务，面向配体-蛋白 docking、虚拟筛选和计算生物化学研究。它把蛋白/配体准备、AutoDock 计算、结果可视化和方法引用整理集成到网页工作流中，目标是让非计算背景的生化研究者也能完成 docking 任务。
平台按蛋白准备、配体准备、对接计算/结果评估组织。蛋白可上传 PDB，或从 Protein Data Bank 检索下载；配体可从 PubChem 下载、上传或用 MarvinSketch 绘制，并设置 pH、结构优化和电荷计算。订阅版支持多配体 SDF 文件，适合小分子库高通量虚拟筛选。底层集成 AutoDock 4、MOPAC2009/PM6、ChemAxon Marvin、Jmol、VMD 等，结果可输出图片、PDF、PDB、mol2、map、dpf 等格式。
定价较透明：免费 Guest、免费注册、3天15美元、1个月79.90美元、年度559.90美元、年度团队2999.90美元。付费差异主要体现在每日计算数、队列优先级、专用处理器、存储空间、MOPAC 量子化学准备、SDF 多配体处理和24小时邮件支持。支付方式文本只明确电汇，需联系邮箱。
优点是流程完整、科研场景明确，能自动处理配体几何、电荷、对接结果、相互作用表和论文方法描述；同时保留高级参数，适合有经验用户。限制也明显：页面显示最后更新为2021年，技术栈含 Java applet；免费版限制较多；文本说明蛋白整体按刚性处理，不支持蛋白-蛋白 docking；也未披露 API、权限体系、安全合规认证。
它更适合高校、药物研发早期、计算化学和生物化学科研团队，用于小规模 docking、候选化合物筛选和论文辅助分析。中国访问状态无法从正文判断；因涉及海外网站、外币/电汇支付和科研数据库，建议正式采购前测试网络连通性、付款可行性与数据合规要求。替代方案可考虑自建 AutoDock/Vina 工作流、PyMOL 生态或本地/云端计算化学平台。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 dockingserver.com 官网实际信息为准。
科研向在线分子对接工具，有免费试用。
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