CRISPR gRNA评分工具
各维度得分依据公开资料与字段推算,加权后即综合评分,仅供参考。
CRISPRscan 是耶鲁大学 Giraldez Lab 开发的 CRISPR/Cas9 gRNA 评分与筛选网站,核心目标是帮助研究者选择更可能产生突变的高质量 gRNA。它不是传统意义上的通用开发者工具,而是面向生命科学研发的专业在线工具,覆盖按基因搜索、提交序列预测、off-target 分析、浏览器轨道查看和结果导出等流程。
从功能看,CRISPRscan 已对所有可用 gRNA 位点进行预测和评分,支持按目标基因检索,也允许用户提交自定义序列并选择基因组预测 off-target。其 off-target 搜索覆盖全基因组,最多支持 4 个错配,并提供多种评分和规则。结果可在基因组上下文中展示,结合基因、序列和蛋白结构域信息辅助判断;蛋白结构域来源包括 Pfam、SMART、PROSITE、HMM-Panther、HAMAP 等。
物种支持是其明显优势。正文提到 zebrafish、Xenopus、human、mouse、Drosophila 等,并在 2024 年新增 Arabidopsis、soybean、rice、sorghum、corn、sea lamprey、apple snail 等,对模式动物和植物研究都较友好。网站还提供 zebrafish、medaka、xenopus、mouse、drosophila 的 genome browser tracks,并区分高分、低分和存在 off-target 的 gRNA 位点。
抓取内容未显示收费、订阅或支付信息,推测偏学术免费工具,但具体授权和服务承诺未说明。API、SDK、开源代码、自托管部署等信息也未出现,因此若需要大规模自动化调用、内网部署或合规审计,现有网页信息不足。
优点是流程贴近 CRISPR 实验设计:能评分、查 off-target、看基因组位置、导出结果,并提供 oligo 与 sgRNA 生成 protocol。缺点是工程化能力披露较少,缺少明确 API、批处理接口、版本化文档和服务 SLA。它更适合科研实验室、生物信息人员、基因功能研究者,用于快速筛选候选 gRNA,而不是作为企业级可集成开发平台。
正文未提供中国大陆访问、镜像或支付说明,访问状态记为未知。如遇网络不稳定,可考虑 CRISPOR、CHOPCHOP、Benchling CRISPR design、CRISPRdirect 等同类工具进行交叉验证。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 crisprscan.org 官网实际信息为准。
耶鲁实验室工具,可辅助选择高效 gRNA。
评分明细(分布与用户短评)接入中。当前展示 TG4G 综合评分,数据源自公开测评与用户反馈。