基因组生信工具平台
各维度得分依据公开资料与字段推算,加权后即综合评分,仅供参考。
BioTools.fr 是由 Andy Saurin 设计和维护的基因组学、转录组学在线生物信息学工具集合。它不是通用开发者平台，而更像科研人员日常使用的 Web 工具箱，覆盖 ChIP 共定位分析、果蝇/小鼠/人类基因工具、PubMed 检索以及若干数据处理小工具。
其核心是 CAT（ChIP Association Tester），可将用户的 peak-called ChIP peaks 与 D. melanogaster、mouse、human 的 modENCODE/ENCODE ChIP peaks 进行比较。系统使用 Genomic Association Tester 预计算蛋白在染色质上的关联，按 observed overlap、expected overlap、p-value 与 sensitivity coefficient 计算得分，用于识别相似或共定位的 ChIP 分布。用户也可上传 BED 文件进行自有数据比较，但结果可能需要约 10 分钟或更久，并需提供邮箱接收。
除 CAT 外，站点提供果蝇表型搜索、FlyBase ID 与 BED 转换、遗传互作和蛋白互作检索；也支持 Mouse/Human/Chicken 的 UCSC、RefSeq、ENSEMBL、Gene Symbol 等 ID 转换。杂项工具包括 Venn 图、列裁剪、BED 坐标扩展、随机抽样、颜色值选择和 qPCR 计算。
正文未说明收费模式，工具看起来可直接在线使用。CAT 源代码明确可从 GitHub 下载并自托管，这是重要加分项；但其他工具是否开源、是否允许批量商用或离线部署并未说明。API/SDK 方面，页面只提到站点使用 PubMed API interface，并未提供面向开发者的独立 API。
优点是工具聚焦科研真实需求，CAT 对 ENCODE/modENCODE 数据支持深入，且解释了评分方法和上传限制，透明度较好。缺点是开发者平台属性较弱，多数能力停留在网页表单层面；批量化、自动化、权限、版本、作业队列和错误处理文档不足。上传 BED 还存在文件数量和等待时间限制。
它适合 ChIP-seq、果蝇遗传学、基因 ID 转换和文献初筛场景下的科研用户，也适合想自建 CAT 的实验室。中国大陆访问情况抓取文本无法判断，标记为未知。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 biotools.fr 官网实际信息为准。
免费生信工具集，科研用户可用。
评分明细(分布与用户短评)接入中。当前展示 TG4G 综合评分,数据源自公开测评与用户反馈。