全球等位基因频率数据库
The Allele Frequency Net Database(AFND)是一个由英国利物浦大学和利物浦皇家大学医院共同维护的公益学术数据库,自2003年上线,专注于存储和检索全球不同人群中免疫相关基因的频率数据。核心覆盖人类白细胞抗原(HLA)、杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)、MHC I类链相关基因(MIC)以及多种细胞因子基因多态性。
网站提供等位基因(allele)、单倍型(haplotype)和基因型(genotype)三个层级的频率检索。当前收录HLA频率约16.4万条、KIR约6731条,数据源自1800多项人群研究、超过1400万名个体。特色功能包括:HLA/KIR频率检索、稀有等位基因检索、低分辨率数据查询、KIR基因型搜索,以及HLA与药物不良反应(HLA-ADR)、KIR与疾病关联等专题模块。数据采用"Gold-Silver-Bronze"质量分级体系,确保使用者能评估数据可靠性。此外支持自动化访问(Automated Access)和数据上传,研究者可贡献自己的人群数据并据此在《Human Immunology》发表短群体报告(SPR)。
完全免费开放,无需付费即可检索。运营依靠TxMiller基金会及Fujirebio、CareDx、Omixon、One Lambda、Immucor等诊断行业企业的赞助维持。
优点在于权威性强、数据量庞大、引用规范清晰(2020 Nucleic Acids Research更新版),并与IMGT/HLA命名标准同步,是免疫遗传学和移植配型研究的标准参考资源。缺点是界面停留在早期Web风格,交互体验落后;KIR底层数据更新滞后(IPD-KIR仍为2015年版本);仅有英文,无中文支持;且抓取页面存在字符编码乱码。目前正在进行二十年来的第二版重大更新,有望改善这些问题。
适合免疫遗传学、移植免疫、群体遗传学、药物基因组学研究人员,以及临床HLA配型实验室。对普通用户门槛较高,需要专业背景才能正确使用查询工具与解读结果。
作为学术机构托管的公开数据库,通常可直连访问,无明显封锁,但访问速度可能因服务器在英国而稍慢。
本测评基于公开资料整理,不构成购买建议,请以 allelefrequencies.net 官网实际信息为准。
HLA等位基因频率学术数据库
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